月经周期的调节主要涉及下丘脑、垂体和卵巢。下丘脑分泌下丘脑促性腺激素释放激素(GnRH)，通过调节垂体促性腺激素的分泌，调控卵巢功能。卵巢分泌的性激素对下丘脑、垂体又有反馈调节作用。下丘脑、垂体与卵巢之间相互调节、相互影响，形成一个完整而协调的神经内分泌系统，称为下丘脑一垂体一卵巢轴(HPOA)。 在产生激素的同时，它们也通过正、负反馈机制严格地控制着激素量，既不能分泌过多，也不能分泌过少。通过神经调节和激素反馈调节，这一系统就可以控制女性的发育、月经周期和性功能。
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